Salah satu indicator institusi pendidikan tinggi yang berkualitas adalah penyelenggaraan kerjasama dengan institusi mitra baik di dalam maupun di luar negeri. Hal ini merupakan salah satu kunci kesuksesan dalam upaya meningkatkan kualitas pendidikan yang diselenggarakan di Fakultas Farmasi UMP dan mendukung peningkatan kualitas sarana dan prasarana yang dibutuhkan oleh seluruh civitas akademika. Mitra kerjasama dapat berkontribusi dalam bentuk pendidikan, penelitian bersama, pengabdian kepada masyarakat, penyelenggaraan seminar / training, dan campus hiring

Kerjasama Dalam negeri

1. Koran Radar Banyumas
2. Koran Suara Merdeka
1. Ikatan Apoteker Indonesia (IAI)
2. PT Mersi Farma Tirmaku Mercusana
3. PT Ferron Par Pharmaceutical
4. PT Zenith Pharmaceuticals
5. PT Landson Pertiwi Agung
6. PT Kimia Farma Plant Smg
7. PT Simex Pharmaceutical
8. PT Merck Sharp Dome
9. PT Glaxo-Smith Klein
10. PT Pyridam Pharma
11. PT Etercon Pharma
12. PT Indofarma. Tbk
13. PT Bintang Tujuh
14. PT Kimia Farma
15. RS PKU Muhammadiyah Yogyakarta
16. RS PKU Muhammadiyah Lamongan
17. RS PKU Muhammadiyah Semarang
18. RS PKU Muhamadiyah Gombong
19. RS PKU Muhammadiyah Bantul
20. RSUD Prof Dr Margono S Purwokerto
21. RSUP Dr.Sardjito Yogyakarta
22. RSUD Tarunadibrata Serang
23. RSUD Tangerang
24. Dinas Kesehatan Banjarnegara
25. Dinas Kesehatan Purbalingga
26. Dinas Kesehatan Pekalongan
27. Dinas Kesehatan Banyumas
28. Dinas Kesehatan Pemalang
29. Apotek Pahala Banjarnegara
30. Apotek Prima Farma
31. Apotek Karya Sehat
32. Apotek Patikraja
33. Apotek Widuri
34. Apotek Adrio
35. Apotek UGM
36. Apotek UMP
1. Viva Generik
2. PT. Century Franchisindo Utama
3. PT. Kimia Farma
4. PT. Mitra Insan Sejahtera

Kerjasama Luar negeri

1. The Centre of International Cooperation in Agricultural Research for Development (CIRAD)
2. ubei University of Chinese Medicine Wuhan, P.R. China
3. Faculty of Pharmaceutical Science, Khon Kaen University
4. University of The Holy Quran And Islamic Sciences Sudan
5. Ifugao State University Lamut, Ifugao, Philippines
6. The Angeles University Foundation, Philippines
7. Nara Institute Science and Technology, Japan
8. Nuvoton Technology Corporation
9. University of Technology, Sydney
10. Centro Escolar University Manila
11. Our Lady of Fatima University
12. Huazhong Normal University
13. Deakin University Australia
14. Cebu Normal, Philippines
15. Massey University
1. The Council of Higher Education of the Central Board of Muhammadiyah and The Southern Border Provinces Administrative Centre (SBPAC)
1. Yeungnam University, Republic of Korea
2. Northern Negros State Collage of Science and Technology, Philippines
3. Universiti Sultan Zainal Abidin (UNIZA-Malaysia)
4. Universiti Pendidikan Sultan Idris (UPSI) Malaysia
5. International Islamic University Malaysia
6. Mahidol University, Thailand
7. Kong Khaen University, Thailand